Ove son or le meraviglie tue O regno di Sicilia? Ove son quelle Chiare memorie, onde potevi altrui Mostrar per segni le grandezze antiche? (Dal Fazello - Storia di Sicilia, deca I,lib. VI,cap.I)

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Alla fine del braccio di croce sinistro è ubicata la Cappella del Santissimo Crocifisso con un bel Portale del 1563 di Giandomenico Mazzola adornato con 14 bassorilievi raffiguranti scene della Passione, Morte e Risurrezione di Gesù. Superato il portale si entra nella cappella che non è molto luminosa e ospita un grande Crocifisso inserito in una nicchia reliquiario, contornato dalle statue della Madonna Addolorata e di San Giovanni. Sono presenti una Via Crucis e altri busti sacri, il sepolcro del vescovo Bonaventura Secusio patrocinatore del convento della chiesa di Sant'Agata la Vetere. L'ambiente ospitava la primitiva Cappella di San Silvestro.