Ove son or le meraviglie tue O regno di Sicilia? Ove son quelle Chiare memorie, onde potevi altrui Mostrar per segni le grandezze antiche? (Dal Fazello - Storia di Sicilia, deca I,lib. VI,cap.I)

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La chiesa ha un impianto basilicale a tre navate suddivise in quattro campate, dotata di transetto che precede l'area presbiterale:questa è composta da un ampio coro absidato e da due cappelle laterali (derivate dagli antichi pròthesis e diacònicon) che concludono visivamente le navate laterali dedicate, rispettivamente, alla Madonna Annunziata (oggi del SS. Sacramento) e alla Madonna del Carmelo. La spazialità interna è scandita da otto poderosi pilastri di sezione cruciforme, sormontati da archi a tutto sesto; le particolari dimensioni dei pilastri dell'intercolumnio contribuiscono notevolmente a rafforzare la sensazione di solennità e di misurato equilibrio classico.

All'interno trovano sette altari in marmo policromo: oltre a quello maggiore, quattro sono ubicati lungo le navate minori e delle due cappelle laterali (due per lato) si trovano in corrispondenza della seconda e quarta campata addossati a nicchie. Tra tutti spicca per pregio quello collocato nella cappella dell'Annunziata, risalente al Settecento e lavorato ad intarsi a rilievo policromi; di notevole interesse è anche l'altare posto sulla parete destra, seconda campata, dedicato a San Vincenzo Ferreri. L'Area presbiterale, è sollevata di tre gradini rispetto alla quota di calpestio interna, le cappelle laterali di un gradino. La navata centrale (sino al catino absidale) ed il transetto sono internamente concluse da volte a botte a tutto sesto così come le cappelle laterali, mentre le campate delle navate minori sono voltate a crociera. Tutti gli spazi che incrociano o guardano il transetto sono demarcati da archivolti rilevati; in particolare, gli arconi della crociera centrale sono decorati da pitture a finti stucchi.
La finitura interna è molto semplice: pareti e pilastri sono rifinite ad intonaco ed una ampia trabeazione di ordine dorico, lavorata a stucco, decora ininterrottamente la navata centrale, il transetto e l'abside.